برای انجام تجزیه کوواریانس بر اساس طرح پایه کاملا تصادفی ) CRD ) و بلوک های کامل تصادفی ( CRBD ) از زیر برنامه شماره 19. FACTOR استفاده می شود .
بدین منظور ابتدا داده ها را از طریق زیر منوهای شماره 20.FILES و 41.SEDIT وارد یا فعال نموده ، آنگاه با زدن کلید Esc به صفحه اصلی MSTAT- C بر می گردیم و بر روی زیر برنامه شماره 19. FACTOR کلید Enter را فشار می دهیم .
پس از مشاهده راهنمای مختصر ( پنجره بالا ) ، مجددا با زدن کلید Enter پنجره زیر باز شود .
در پنجره بالا پرسیده می شود ، آیا تمایل به انجام تجزیه کوواریانس دارید . با تایپ حرف Y و زدن کلید Enter پنجره زیر باز می شود .
در پنجره بالا باز منابع تغییر و درجه آزادی مدل مزبور نمایش داده می شود ، در صورت عدم صحت منابع تغییر و درجه آزادی مدل ، حرف N را تایپ نموده و کلید Enter را می زنیم تا به صفحه اصلی بر گردد و مدل صحیح را انتخاب می نماییم ولی در صورت صحت ، حرف Y را تایپ نموده و کلید Enter را می زنیم.
درسطر اول پنجره فوق ، شماره ستون بلوک ( تکرار ) ، در سطر دوم و سوم به ترتیب کوچکترین و بزرگترین شماره تکرار وارد می شود ( در مثال فوق آزمایش دارای 3 تکرار بود ) آنگاه کلید Enter را فشار می دهیم.
درسطر اول پنجره فوق ، شماره ستون فاکتور A ، در سطر دوم و سوم به ترتیب کوچکترین و بزرگترین شماره فاکتور A تایپ می گردد . ( در مثال فوق فاکتور A دارای 3 سطح بود ) سپس کلید Enter را می زنیم.
درسطر اول پنجره فوق ، شماره ستون فاکتور B ، در سطر دوم و سوم به ترتیب کوچکترین و بزرگترین شماره فاکتور B تایپ می گردد . ( در مثال فوق فاکتور B دارای 2 سطح بود ) آنگاه کلید Enter را فشار می دهیم .تا پنجره زیر باز شود .
در صورت صحت تعدادتکرار و تعداد سطوح فاکتور A و B حرف Y را تایپ نموده و کلید Enter را می زنیم . در صورت عدم صحت تعداد تکرار و تعداد سطوح فاکتور A و B در پنجره فوق ، حرف N را تایپ نموده و کلید Enter را فشار می دهیم تا مجددا پنجره های سه گانه فوق باز شوند .
در پنجره بالا شماره ستون مربوط به مقادیر کوواریت وارد می شود .
در پنجره فوق تعداد ردیف ها پرسیده می شود ، در صورت عدم صحت حرف N را تایپ نموده و کلید Enter را فشار می دهیم و در پنجره باز شده تعداد صحیح ردیف ها را تایپ می کنیم .
در پنجره فوق ستونی که مقادیر کوواریت در آن قرار دارند با Space bar انتخاب می شود .
در پنجره زیر ، پیغامی مبنی بر ذخیره میانگین متغیر یا متغیرها در انتهای فایل داده پرسیده می شود ، که حرف Y را تایپ نموده و کلید Enter را می زنیم.
از پنجره زیر منوی اول ( view output on screen ) را انتخاب می کنیم تا اطلاعات بصورت زیر نمایش داده شود .
